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對(duì)于使用染料法的定量PCR反應(yīng),雖然有各種各樣的PCR引物設(shè)計(jì)軟件或者經(jīng)驗(yàn)公式計(jì)算熔解溫度(Tm值),但運(yùn)用的公式不同、引物序列不同,Tm值的差異會(huì)很大。

引物的熔解溫度決定了退火溫度。而且模版中堿基的組合千變?nèi)f化,對(duì)于特殊片斷,基因擴(kuò)增儀廠家,經(jīng)驗(yàn)公式得到的數(shù)據(jù)不一定能得出準(zhǔn)確的結(jié)果,基因擴(kuò)增儀,退火溫度細(xì)微的差異對(duì)結(jié)果都可能產(chǎn)生決定性的影響,因而“摸條件”一度是讓人很頭疼的問題。梯度PCR的出現(xiàn)部分解決了一些問題——在反應(yīng)過程中每個(gè)孔的溫度控制條件可以在指l定范圍內(nèi)按照梯度變化,根據(jù)結(jié)果,一步就可以摸索出最適合的反應(yīng)條件。
不單退火溫度,連變性溫度和延伸溫度都可以優(yōu)化——對(duì)于多種聚合酶混合酶擴(kuò)增如Invitrogen、Clontech、Promega的多數(shù)高保真Taq酶來說這個(gè)非常重要,因?yàn)門aq和校正酶的最l佳反應(yīng)溫度可能有顯著差異,優(yōu)化延伸溫度就顯得很重要。
熒光定量PCR儀是PCR儀中的一種,普通基因擴(kuò)增儀,熒光定量PCR儀都可以檢測哪些的項(xiàng)目呢?今天君意生物的小編就和大家一起來看看吧:

mRNA定量
熒光定量PCR可以對(duì)基因的表達(dá)進(jìn)行定量分析,可以通過外標(biāo)準(zhǔn)品定量的制備來實(shí)驗(yàn)基因表達(dá)的絕l對(duì)定量,也可以利用內(nèi)參相對(duì)定量基因表達(dá)水平的變化。
miRNA定量
MicroRNAs (miRNAs)是一種大小約21—23個(gè)堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個(gè)堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(雙鏈)但是和siRNA密切相關(guān)。成熟的microRNA是由21-25個(gè)核苷酸組成的小RNA,長度太短,并不能通過傳統(tǒng)的實(shí)時(shí)定量PCR進(jìn)行檢測,梯度pcr基因擴(kuò)增儀,但是通過特殊設(shè)計(jì)的莖環(huán)結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄引物,配合實(shí)時(shí)定量PCR引物及探針可以精準(zhǔn)檢測微量樣品中microRNA表達(dá)水平。
定性分析
熒光定量PCR還可以用來檢測單核苷酸多態(tài)性(SNP)、點(diǎn)突變、等位基因以及DNA甲l基化等。能夠簡單快速地對(duì)目的基因進(jìn)行高特異性、高靈敏度的檢測,同時(shí)閉管操作的實(shí)時(shí)檢測可以有效防止反應(yīng)產(chǎn)物的污染。

注冊資金: 51萬元
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