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現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)研究中為了更好地理解人體生命的作用過程和疾病的產(chǎn)生機(jī)理,需要觀察細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞器、病毒、等在三維細(xì)胞空間的定位和分布.另一方面,后基因組時(shí)代蛋白質(zhì)科學(xué)的研究也要求闡明:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、定位與功能的關(guān)系以及蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)之間發(fā)生相互作用的時(shí)空順序;生物大分子,主要是結(jié)構(gòu)蛋白與 RNA 及其復(fù)合物,如何組成細(xì)胞的基本結(jié)構(gòu)體系;重要的活性因子如何調(diào)節(jié)細(xì)胞的主要生命活動(dòng),如細(xì)胞增殖、細(xì)胞分化、細(xì)胞凋亡與細(xì)胞信號(hào)傳遞等.反映這些體系性質(zhì)的特征尺度都在納米量級(jí),遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了常規(guī)的光學(xué)顯微鏡(激光掃描共聚焦顯微鏡等)的分辨極限(xy 向分辨率:200 nm,
z 向分辨率:500 nm)。

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