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細胞系鑒定與STR的關系
STR(Short TandemRepeat,短串聯(lián)重復序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等機構作為金標準應用于細胞鑒定 。
STR基因位點由長度為3~7個堿基對的短串連重復序列組成, 這些重復序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標記,被稱為細胞的DNA指紋。STR 基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內重復序列的拷貝數的不同來區(qū)分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據所得的STR分型結果與細胞STR數據庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。
類細胞16個基因座檢測:所選用的基因座跟ATCC和JCRB細胞庫中的基因座完全一致,可方便與數據庫進行比對。2.人類細胞20個基因座檢測:是目前基因座的檢測服務,兼容以上各組數據之外更添加4個高度多態(tài)性位點——D19S433、D6S1043、D12S391和D2S1338,具有更高的準確性.3.小鼠細胞檢測:分析小鼠基因組中8個高度多態(tài)性位:D1Mit159.1、D2Mit395.1、D4Mit170.1、D7Mit40、D11Mit4、D15Mit16、D17Mit51.1和Jarid1。4.人鼠細胞交叉污染檢測:國內技術,采用人鼠復合擴增體系檢測人類細胞中的小鼠細胞污染,主要應用在研究領域。同時可以用于判斷人鼠細胞混淆的情況。
但是這些細胞傳代的次數、培養(yǎng)的條件以及是否有污染等都無法得到保障,甚至有老師買了這種細胞做了很多的實驗都沒有結果,很長時間之后才發(fā)現(xiàn)細胞被污染了。為了讓您解除后顧之憂,我們建議您在獲得細胞系的時候、細胞傳代一段時間之后以及即將發(fā)表的之前,都對您的細胞進行 STR 鑒定。以確保您使用細胞的正確性。使用正確的細胞,是您實驗成功的一半。完整的細胞STR檢測報告請查閱(STR Report-Sample),報告上會列出受檢細胞系STR基因分型結果附表(圖2),表格中將列出所有實際檢測位點信息。第2列“Sample”為樣本檢測得到的STR位點信息, 該結果是根據實際PCR擴增后檢測到的片段長度得到的數據信息。第3列為ATCC、Z等數據庫中標準細胞STR位點信息。數據庫中常規(guī)提供9個位點信息,即 Amelogenin, CSF1PO, D13S317, D16S539, D5S818, D7S820, THO1, TPOX, vWA。 