| 線粒體DNA提取試劑盒 一,試劑盒組份 | 組份 | D0040 (50T) | P0040 (100T) | | 細(xì)胞裂解液 | 50 mL | 100 mL | | 線粒體清洗液 | 25 mL | 50 mL | | DNA酶I | 12mg | 22mg | | DNA酶反應(yīng)液 | 6ml | 12ml | | 線粒體裂解液 | 10ml | 20ml | | 蛋白沉淀液 | 7.5ml | 15ml | | 核酸助沉劑 | 0.5ml | 1ml | | TE緩沖液 | 15ml | 30ml | 二,保存條件 本試劑盒整體保存于2-8度一年。使用前,在DNA酶I中加入600ul(50T)或者1100ul(100T)的DNA酶反應(yīng)液,分裝后-20度保存。線粒體裂解液使用前常溫保存,如有沉淀可37度水浴溶解,不影響使用。 三,說明 線粒體DNA提取的關(guān)鍵是盡可能的去掉核DNA。本試劑盒利用差速離心到比較純凈的線粒體,再利用DNA酶消化裂解緩沖系統(tǒng)等多步驟去掉核DNA,最后得到純凈的線粒體DNA??捎糜?/span>PCR等對純度要求較高的實(shí)驗(yàn)。 本試劑盒用于從動(dòng)物細(xì)胞或組織中分離出完整而純化的線粒體。適合于動(dòng)物軟組織(肝或腦組織)和硬組織(肌肉)以及培養(yǎng)細(xì)胞線粒體DNA的提取制備。不適合植物及其他標(biāo)本的提取。 四,操作步驟 準(zhǔn)備工作:在DNA酶I中加入600ul(50T)或者1100ul(100T)的DNA酶反應(yīng)液,適當(dāng)分裝后-20度保存。線粒體裂解液保存于常溫,如有沉淀37℃水浴溶解,離心機(jī)溫度下降到4℃(2-8℃),如無低溫離心機(jī),也可以常溫離心,并將離心時(shí)間為10min的改為5min,但最后所得DNA品質(zhì)及產(chǎn)量可能會(huì)有一定影響。 1. 樣本處理 a. 組織勻漿:稱取100~200 mg新鮮組織如肝臟、腦、心肌等,PBS或生理鹽水沖洗,洗凈血水,濾紙吸干,用剪為碎塊放入小容量玻璃勻漿器內(nèi)。加入1.0 mL冰預(yù)冷的Lysis Buffer,0℃冰浴上下研磨組織20次; b. 培養(yǎng)細(xì)胞勻漿:消化細(xì)胞,PBS洗滌,800 × g 5~10 min離心收集細(xì)胞。計(jì)數(shù)。每次提取需要5 × 107個(gè)細(xì)胞,加入1.0 mL冰預(yù)冷的Lysis Buffer重懸細(xì)胞,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到小容量玻璃勻漿器內(nèi),0℃冰浴研磨30~40次; 2. 將組織或細(xì)胞勻漿物轉(zhuǎn)移到離心管,4℃,1000× g 離心5 min; 3. 取上清,加入一新的離心管中,4℃,1000× g 再次離心5 min。 4.取上清,加入一新的離心管中,4℃, 12,000 × g 離心10 min。離心后的上清含胞漿成分,可從中提取胞漿蛋白。將上清轉(zhuǎn)移到新離心管,線粒體沉淀在管底; 5. 在線粒體沉淀中加入0.5 mL Wash Buffer重懸線粒體沉淀,4℃,1000× g 離心5 min; 6.取上清,加入一新的離心管中,4℃, 12,000 × g 離心10 min。棄上清,高純度的線粒體沉淀在管底; 7. 加入100ul DNA酶反應(yīng)液重懸線粒體,吹打均勻后,再加入10ul DNA酶I溶液(見準(zhǔn)備工作),混勻,37度水浴10min。此步為消化線粒體表面吸付的核DNA。4℃, 12,000 × g 離心5 min。盡可能的棄上清,再加入200ul TE 重懸線粒體沉淀,離心,洗去殘留的DNA酶。 8.得到的沉淀,用100ul TE 重懸線粒體沉淀。加入200ul線粒體裂解液,輕輕混勻(不可吹打),放置2min左右,不超過5min,再加入150ul蛋白沉淀液,迅速混勻。4℃, 12,000 × g 離心5 min。此步驟可進(jìn)一步去除核DNA。 9.取上清,加入一新的離心管中(可選用等體積的酚異25:24:1抽提一次,再用抽提一次,或者直接用抽提兩次,一般來說,此步可省,并不影響后續(xù)的PCR),加入0.6倍體積的(如無,可加入2.5倍體積的沉淀DNA)及10ul核酸核酸助沉劑,混勻,-20℃沉淀半小時(shí)左右(此步可省),4℃, 12,000 × g 離心10 min。 10. 棄上清,再加入1ml 70%,4℃, 12,000 × g 離心10 min。重復(fù)用70%洗一次。 11. 棄上清后再次離心1min 吸棄上清,開蓋涼干約5-10分鐘。 12.加入20-30ul TE緩沖液,輕彈管底,37度水浴5分鐘,線粒體DNA溶解。 13. 進(jìn)行DNA電泳檢測及-20度保存,進(jìn)行下步的實(shí)驗(yàn)。 四 注意事項(xiàng): 1. 為保證獲得完整及盡可能多的線粒體,勻漿條件要示:是全程低溫操作。第二是快速。第三,如用條件可將勻漿后的碎片在顯微鏡下觀察。與組織塊相比,培養(yǎng)細(xì)胞特別是貼壁培養(yǎng)細(xì)胞在用玻璃勻漿器勻漿時(shí)較難破壁,因而要選用小容量玻璃勻漿器、間隙嚴(yán)密的研杵上下研磨培養(yǎng)細(xì)胞。 2.線粒體DNA本身含量很低,如果電泳檢測不到,可加大上樣量,用更少量的TE溶解沉淀,或者直接進(jìn)入PCR檢測。 2. 以離心力g計(jì)算正確的離心速度,不同的離心機(jī)可據(jù)此計(jì)算離心速度。 |