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RNA pull down 檢測
RNA? ?pull down:RNA沉淀檢測,是檢測RNA結(jié)合蛋白與其靶RNA之間相互作用的主要實驗方法之一。使用體外轉(zhuǎn)錄將RNA進行生物素標(biāo)記,并與細胞蛋白裂解液孵育,形成RNA-蛋白復(fù)合物。復(fù)合物通過磁珠結(jié)合后分離,復(fù)合物純化洗脫后通過Western blot驗證檢測特性的蛋白。若篩選可能結(jié)合的蛋白通過質(zhì)譜實驗進行檢測篩選。
注意事項
1. 為了避免蛋白質(zhì)變性,不要對樣品劇烈攪動和反復(fù)凍融。
2. 緩沖溶液成分盡量模擬細胞內(nèi)環(huán)。。
3. 為了避免蛋白質(zhì)的氧化,將 0.1~1 mmol/LDTT(二硫蘇糖醇)(或 β-巰)加入到緩沖溶液中。
4. 為了避免重金屬對目標(biāo)蛋白的破壞,pcr引物設(shè)計,將 1~10 mmol/LEDTA 金屬螯合劑加入。
5. 為了避免微生物生長,使用溶液。在純化任何一種蛋白質(zhì)的時候,dna檢測,均必須時刻對它的穩(wěn)定性注意維護,使它的活性得到保護,需要牢記如下一些通用的注意事項。
6. 盡可能置于冰上或者在冷庫內(nèi)進行操作。
7. 蛋白濃度不要太稀。
8. 除非是進行聚焦層。否則 pH 需要合適,防止所使用的緩沖溶液 pH 與 pI 相同,使蛋白質(zhì)的沉淀得以避免。
9. 使用蛋白酶,避免蛋白酶對目標(biāo)蛋白的降解;在純化細胞中的蛋白質(zhì)時,將 DNA 酶加入來使得 DNA 降解,避免 DNA 對蛋白的污染。
