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microRNA芯片:
RNA干擾(RNA Interference, RNAi)現(xiàn)象是一種進(jìn)化上保守的抵御轉(zhuǎn)基因或外來病毒qin犯的防御機制。將含有靶基因mRNA同源互補序列的RNA(Double strand RNA, dsRNA)導(dǎo)入細(xì)胞后,能夠特異地識別該mRNA,引起mRNA的降解,從而導(dǎo)致相應(yīng)的功能缺失。RNAi提供了一種經(jīng)濟(jì)、快捷、gao效的抑制特異基因表達(dá)的技術(shù)手段,該技術(shù)已被廣泛用于研究基因功能和chuan染性疾病及惡xingzhong瘤基因zhi療領(lǐng)域。目前常用的RNA干擾手段為miRNA、 shRNA和siRNA等。
MiRNA是一類可以通過RNAi機制調(diào)節(jié)基因表達(dá)的內(nèi)源性小RNA,人工miRNA與shRNA的設(shè)計原理基本相同,由于miRNA具有內(nèi)源性,因此其更易產(chǎn)生有效的基因沉默。
技術(shù)流程:
dsRNA或pre-miRNA被導(dǎo)入細(xì)胞后,能夠被一種特異的核酸內(nèi)切酶(Dicer)識別并切割成為小片段,這些片段在RNA解旋酶的作用下解鏈。繼之反義鏈在與體內(nèi)一些酶(包括內(nèi)切酶、外切酶、解旋酶等)結(jié)合形成RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RNA-Induced Silencing Complex,RISC),RNA pull-down檢測實驗,RISC與mRNA同源區(qū)進(jìn)行特異性結(jié)合,若miRNA與mRNA的結(jié)合位點配對,則切割mRNA;若miRNA與mRNA的結(jié)合位點不配對,則抑制mRNA的翻譯。






轉(zhuǎn)錄組測序
轉(zhuǎn)錄組即某個物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的RNA的總和,是研究細(xì)胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉(zhuǎn)錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細(xì)胞在不同的生長時期及生長環(huán)境下,其基因表達(dá)情況是不相同的。轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)是指利用第二代高通量測序技術(shù)進(jìn)行cDNA測序,快速地獲取某一物種特定qi官或組織在某一狀態(tài)下的轉(zhuǎn)錄本。相對于傳統(tǒng)芯片而言,RNA-Seq無需預(yù)先設(shè)計探針,即可對物種的細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行檢測,能夠提供較的數(shù)字化信號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測范圍,是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的良好工具。
腺病毒包裝原理介紹
腺病毒是一種沒有包膜的直徑為79-90nm的顆粒,由252個 殼粒呈二十面體排列構(gòu)成。每個殼粒的直徑為7-9nm。衣殼里是線狀雙鏈DNA分子,兩端各有長約100bp的反向重復(fù)序列。人體腺病毒 已知有33種,分別命名為ad1-ad33,研究詳細(xì)得是ad2.
腺病毒是一種無包膜的球型結(jié)構(gòu)的病毒,遺傳物質(zhì)為線型 雙股DNA形式。腺病毒的特點:(1)gan染范圍廣對人致病性低;(2)對增殖和非增殖細(xì)胞均具有g(shù)an染性;(3)能有效進(jìn)行增殖;( 4)病毒滴度高;(5)不整合到染色體中,無插入致突變性;(6)外源基因裝載容量大。由于腺病毒的這些特點使其廣泛地應(yīng)用于體 外基因轉(zhuǎn)導(dǎo)、體內(nèi)接種yi苗、和基因zhi療等各個領(lǐng)域。
實驗方法
1.獲得目的基因序列;
2.構(gòu)建病毒表達(dá)載體質(zhì)粒;
3.表達(dá)載體質(zhì)粒和包裝質(zhì)粒重組;
4.gan染HEK293,包裝出病毒;
5.病毒擴增、濃縮;
6.滴度測定。
注冊資金:100萬(元)
聯(lián)系人:戴經(jīng)理
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