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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
轉(zhuǎn)錄組即某個(gè)物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的RNA的總和,是研究細(xì)胞表型和功能的一個(gè)重要手段。與基因組不同的是,檢測(cè),轉(zhuǎn)錄組的定義中包含了時(shí)間和空間的限定。同一細(xì)胞在不同的生長(zhǎng)時(shí)期及生長(zhǎng)環(huán)境下,其基因表達(dá)情況是不相同的。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-Seq)是指利用第二代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行cDNA測(cè)序,快速地獲取某一物種特定qi官或組織在某一狀態(tài)下的轉(zhuǎn)錄本。相對(duì)于傳統(tǒng)芯片而言,蛋白雙向電泳,RNA-Seq無(wú)需預(yù)先設(shè)計(jì)探針,即可對(duì)物種的細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行檢測(cè),能夠提供較的數(shù)字化信號(hào),更高的檢測(cè)通量以及更廣泛的檢測(cè)范圍,是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的良好工具。
Southern雜交
實(shí)驗(yàn)原理
? ? ? Southern印跡雜交(Southern blot)是1975年由英國(guó)人southern創(chuàng)建,SNP芯片檢測(cè),是研究DNA圖譜的基本技術(shù)。Southern印跡雜交是進(jìn)行基因組DNA特定序列定位的通用方法。一般利用瓊脂糖凝膠電泳分離經(jīng)限制性內(nèi)切酶消化的DNAl片段,將膠上的DNA變性并在原位將單鏈DNAl片段轉(zhuǎn)移至尼龍膜或其他固相支持物上,經(jīng)干烤或者紫外線照射固定,再與相對(duì)應(yīng)結(jié)構(gòu)的標(biāo)記探針進(jìn)行雜交,用放l射自顯影或酶反應(yīng)顯色,從而檢測(cè)特定DNA分子的含量。

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