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miRNA測序
microRNA(miRNA)是一種大小約21—23個堿基的單鏈小分子RNA,SNP芯片檢測,是由具有發(fā)夾結構的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經(jīng)過Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(雙鏈)但是和siRNA密切相關。microRNA通過和靶基因mRNA堿基配對引導沉默復合體(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻譯,從而在轉錄后水平調控蛋白表達(新發(fā)現(xiàn)miRNA也能在轉錄水平調控基因表達)。miRNA在物種進化中相當保守,在動物、植物和等中發(fā)現(xiàn)的miRNA表達均有嚴格的組織特異性和時序性。miRNA在細胞生長和發(fā)育過程中起多種作用,包括調控發(fā)育、分化、凋亡和增殖等。
目前研究miRNA的方法主要是realtime-PCR、生物芯片技術以及第二代測序技術。基于第二代測序技術的miRNA測序,可以一次獲得數(shù)百萬條miRNA序列,能夠快速鑒定出不同組織、不同發(fā)育階段、不同疾病狀態(tài)下已知和未知的miRNA及其表達差異,為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力工具。





凝膠阻滯遷移電泳檢測服務(EMSA)

分子實驗介紹——印跡(Western blot)檢測
通過SDS-PAGE凝膠將細胞或生物樣品內的蛋白按照蛋白分子量從大到小規(guī)律分離開。經(jīng)過PAGE分離的蛋白質樣品,轉移到固相載體(例如纖維素薄膜或PVDF膜)上,固相載體以非共價鍵形式吸附蛋白質,且能保持電泳分離的多肽類型及其生物學活性不變。以固相載體上的蛋白質或多肽作為抗原,與對應的起反應,再與酶或同位素標記的第二起反應(目前主要用HRP標記的第二),經(jīng)過底物顯色或自顯影以檢測電泳分離的特異性目的基因表達的蛋白成分(目前主要使用魯米諾和二抗中的HRP反應發(fā)出熒光,通過儀器或者膠片顯色)。該技術廣泛應用于檢測蛋白水平的表達。
實驗流程:細胞收集-細胞裂解,蛋白提取-蛋白變性-SDS-PAGE電泳-蛋白質轉膜印記-蛋白封閉-目的孵育-二抗孵育-顯色拍照
結果示例:
圖 A不同大小的質粒轉染細胞后,Western blot檢測圖片;B A蛋白不同培養(yǎng)時間后Western blot檢測圖片;C 使用Image pro plus軟件對A蛋白灰度檢測,A蛋白表達變化統(tǒng)計圖
